Po to, kai 1996 m. amerikiečių mokslininkas Ericas S. Landeris oficialiai pasiūlė vieno nukleotido polimorfizmą (SNP) kaip trečios kartos molekulinį žymenį, SNP buvo plačiai naudojamas ekonominių požymių asociacijų analizei, biologinių genetinių ryšių žemėlapių kūrimui ir žmogaus patogeninių genų atrankai., Ligų rizikos diagnostika ir prognozavimas, individualizuota vaistų patikra ir kitos biologinių bei medicinos tyrimų sritys.Grynųjų kultūrų auginimo srityje SNP aptikimas gali padėti anksti pasirinkti reikiamus požymius.Ši atranka pasižymi didelio tikslumo savybėmis ir gali veiksmingai išvengti morfologijos ir aplinkos veiksnių trukdžių, taip labai sutrumpinant veisimo procesą.Todėl SNP vaidina didžiulį vaidmenį pagrindinių tyrimų srityje.

Vieno nukleotido polimorfizmas (Single Nucleotide Polymorphism, SNP) reiškia reiškinį, kad yra vieno nukleotido skirtumai toje pačioje padėtyje tos pačios arba skirtingų rūšių individų DNR sekoje.Vienos bazės įterpimas, ištrynimas, konvertavimas ir apvertimas gali sukelti šį skirtumą.Anksčiau SNP apibrėžimas skyrėsi nuo mutacijos.Variantinis lokusas reikalauja, kad vieno iš alelių dažnis populiacijoje būtų didesnis nei 1%, kad jį būtų galima apibrėžti kaip SNP lokusą.Tačiau plečiantis šiuolaikinėms biologinėms teorijoms ir pritaikius technologijas, alelių dažnis nebėra būtina sąlyga apriboti SNP apibrėžimą.Pagal Nacionalinio biotechnologijos informacijos centro (NCBI) duomenų bazę apie vieno nukleotido polimorfizmus (dbSNP) įtrauktus vieno nukleotido variacijos duomenis, taip pat įtraukiami žemo dažnio įterpimas / trynimas, mikropalydovo variacija ir kt.

Žmogaus kūne SNP dažnis yra 0,1%.Kitaip tariant, 1000 bazinių porų yra vidutiniškai viena SNP vieta.Nors pasireiškimo dažnis yra gana didelis, ne visos SNP vietos gali būti kandidatai, susiję su bruožais.Tai daugiausia susiję su vieta, kurioje atsiranda SNP.

Teoriškai SNP gali atsirasti bet kurioje genomo sekos vietoje.SNP, atsirandantys koduojančiame regione, gali sukelti sinonimines mutacijas ir nesinonimiškas mutacijas, ty aminorūgštys keičiasi arba nepasikeičia prieš ir po mutacijos.Dėl pasikeitusios aminorūgšties peptidinė grandinė paprastai praranda savo pradinę funkciją (missense mutacija), taip pat gali sukelti vertimo nutraukimą (nesąmoningą mutaciją).SNP, atsirandantys nekoduojančiuose regionuose ir tarpgeniniuose regionuose, gali turėti įtakos mRNR susijungimui, nekoduojančios RNR sekos kompozicijai ir transkripcijos faktorių bei DNR surišimo efektyvumui.Konkretus ryšys parodytas paveikslėlyje:

SNP tipai:

Keli įprasti SNP tipavimo metodai ir jų palyginimas

Pagal skirtingus principus įprasti SNP aptikimo metodai skirstomi į šias kategorijas:

Aptikimo metodų klasifikacinis palyginimas

Pastaba: lentelėje išvardyti šiuo metu naudojami labiau paplitę SNP aptikimo metodai, kiti aptikimo metodai, tokie kaip specifinės vietos hibridizacija (ASH), specifinės vietos pradmenų išplėtimas (ASPE), vienos bazės išplėtimas (SBCE), specifinės vietos išpjovimas (ASC), genų lustų technologija, masės spektrometrijos technologija ir kt.

Nukleino rūgščių gryninimo kaina ir laikas taikant aukščiau nurodytus kelis įprastus SNP aptikimo metodus yra neišvengiami.Tačiau susiję rinkiniai, pagrįsti tiesiogine Foregene PGR technologija, gali tiesiogiai atlikti PGR arba qPCR amplifikaciją neišgrynintuose mėginiuose, o tai suteikia precedento neturintį patogumą SNP aptikimui.

Foregene tiesioginio PGR serijos gaminiuose paprastai ir apytiksliai praleidžiami mėginių valymo etapai, o tai labai sumažina šablonų paruošimo laiką ir išlaidas.Unikali Taq polimerazė pasižymi puikiomis amplifikacijos savybėmis ir gali toleruoti įvairius inhibitorius iš sudėtingos amplifikacijos aplinkos.Šios charakteristikos suteikia techninę garantiją norint gauti didelio derlingumo specifinius produktus.Foregene Direct PCR/qPCR rinkiniai, skirti įvairių tipų mėginiams, tokiems kaip: gyvūnų audiniai (žiurkės uodega, zebrafish ir kt.), augalų lapai, sėklos (įskaitant polisacharidų ir polifenolių mėginius) ir kt.